Parámetros recomendados para trascodificar video sin perder calidad con ffmpeg
Para el caso de archivos en formato .MTS filmados a 24fps:
ffmpeg -i archivo-in -r 24 -vcodec libx264 -crf 18 archivo-out.avi
Más info del uso del codec h264 en ffmpeg en: trac.ffmpeg.org/wiki/Encode/H.264